Zespół kierowany przez prof. Katarzynę Lisowską
Główne kierunki badań
- Zastosowanie wysokoprzepustowych analiz genomicznych (mikromacierze DNA, sekwencjonowanie nowej generacji; NGS) do identyfikacji nowych markerów molekularnych o potencjalnym znaczeniu w diagnostyce chorób nowotworowych.
- Poszukiwanie korelacji między poziomem ekspresji wybranych genów/białek w guzie, a cechami klinicznymi nowotworu
- Badanie biologicznej roli wybranych genów/białek w procesie nowotworzenia i w progresji nowotworu, na modelu in vitro
- Poszukiwanie biomarkerów oporności na nowy inhibitor dla receptora czynnika wzrostu fibroblastów (FGFR) opracowany przez polską firmę farmaceutyczną CelonPharma.
Naszym niedawnym osiągnieciem jest wyprowadzenie nowej linii komórkowej do badań nad niskozróżnicowanym rakiem jajnika. Badania te opublikowane zostały w artykule pt. Establishment and Characterization of the Novel High-Grade Serous Ovarian Cancer Cell Line OVPA8; pisała o tym także Polska Agencja Prasowa (PAP). Linia komórkowa została przekazana do dwóch repozytoriów: ECACC (European Collection of Autenthicated Cell Cultures, https://www.phe-culturecollections.org.uk/products/celllines/generalcell/detail.jsp?refId=19062601&collection=ecacc_gc) w Anglii i DSMZ (Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen, https://www.dsmz.de/collection/catalogue/details/culture/ACC-871) w Niemczech.
Zespół
Katarzyna Lisowska, Ph.D., (group leader) | Profesor zwyczajny | katarzyna.lisowska@gliwice.nio.gov.pl | +48 32 278 9888 |
Katarzyna Kujawa, Ph.D. | Biotechnolog | katarzyna.kujawa@gliwice.nio.gov.pl | +48 32 278 9888 |
Alexander Cortez, Ph.D. | Asystent | alexander.cortez@gliwice.nio.gov.pl | +48 32 278 9885 |
Joanna Syrkis, M.Sc. | Doktorantka | joanna.syrkis@gliwice.nio.gov.pl | +48 32 278 9881 |
Patrycja Jakubowska, M.Sc. | Starszy technik | patrycja.jakubowska@gliwice.nio.gov.pl | +48 32 278 9881 |
Publikacje Naukowe
Rak jajnika:
- Kujawa KA, Zembala-Nożynska E, Syrkis JP, Cortez AJ, Kupryjańczyk J, Lisowska KM (2022): Microfibril Associated Protein 5 (MFAP5) Is Related to Survival of Ovarian Cancer Patients but Not Useful as a Prognostic Biomarker. Int J Mol Sci. 23(24):15994. doi: 10.3390/ijms232415994
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36555638/ - Cortez AJ, Kujawa KA, Wilk AM, Sojka DR, Syrkis JP, Olbryt M, Lisowska KM (2020): Evaluation of the Role of ITGBL1 in Ovarian Cancer. Cancers. 12, 2676; doi:10.3390/cancers12092676
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32961775/
- Kujawa KA, Zembala-Nożyńska E, Cortez AJ, Kujawa T, Kupryjańczyk J, Lisowska KM (2020): Fibronectin and periostin as prognostic markers in ovarian cancer. Cells. 9, 149; doi:10.3390/cells9010149
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7016975/
- Tudrej P, Kujawa KA, Cortez AJ, Lisowska KM (2019): Characteristics of in Vivo Model Systems for Ovarian Cancer Studies. Diagnostics. 9, 120; doi:10.3390/diagnostics9030120
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31540126/
- Tudrej P, Kujawa KA, Cortez AJ, Lisowska KM (2019): Characteristics of in vitro model systems for ovarian cancer studies. Oncol. Clin. Pract. 15; doi: 10.5603/OCP.2019.0024
https://journals.viamedica.pl/oncology_in_clinical_practice/article/view/63663
- Tudrej P, Olbryt M, Zembala-Nożyńska E, Kujawa KA, Cortez AJ, Fiszer-Kierzkowska A, Pigłowski W, Nikiel B, Głowala-Kosińska M, Bartkowska-Chrobok A, Smagur A, Fidyk W,,Lisowska KM (2018): Establishment and Characterization of the Novel High-Grade Serous Ovarian Cancer Cell Line OVPA8. Int. J. Mol. Sci. 19(7); doi:10.3390/ijms19072080
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30018258/
- Cortez AJ, Tudrej P, Kujawa KA, Lisowska KM (2018): Advances in ovarian cancer therapy. Cancer Chemother. Pharmacol. 81:17–38; doi: 10.1007/s00280-017-3501-8
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29249039/
- Lisowska KM, Olbryt M, Student S, Kujawa KA, Cortez AJ, Simek K, Dansonka-Mieszkowska A, Rzepecka IK, Tudrej P, Kupryjańczyk J (2016): Unsupervised analysis reveals two molecular subgroups of serous ovarian cancer with distinct gene expression profiles and survival. J. Cancer Res. Clin. Oncol. 142(6): 1239-1252; doi: 10.1007/s00432-016-2147-y
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27028324/
Surowe dane mikromacierzowe (raw data, Gene Expression Omnibus: GSE63885)
- Kujawa KA, Lisowska KM (2015): Rak jajnika – od biologii do kliniki. Post. Hig. Med. Dosw. 69: 1275-1290; doi: 10.5604/17322693.1184451
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26671919/
- Szafron LM, Balcerak A, Grzybowska EA, Pienkowska-Grela B, Podgorska A, Zub R, Olbryt M, Pamula-Pilat J, Lisowska KM, Grzybowska E, Rubel T, Dansonka-Mieszkowska A, Konopka B, Kulesza M, Lukasik M, Kupryjanczyk J (2015): The putative oncogene, CRNDE, is a negative prognostic factor in ovarian cancer patients. Oncotarget. 6(41): 43897-910; doi: 10.18632/oncotarget.6016
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26556866/
- Lisowska KM, Olbryt M, Dudaladava V, Pamuła-Piłat J, Kujawa K, Grzybowska E, Jarząb M, Student S, Rzepecka IK, Jarząb B, Kupryjańczyk J (2014): Gene expression analysis in ovarian cancer – faults and hints from DNA microarray study. Front Oncol. 4: 1-11; doi: 10.3389/fonc.2014.00006
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24478986/
Surowe dane mikromacierzowe (raw data, Gene Expression Omnibus: GSE63885)
- Lisowska K(2007): Profil ekspresji genów w raku jajnika: znaczenie dziedzicznej mutacji genu BRCA1 na tle innych cech molekularnych i klinicznych guza (rozprawa habilitacyjna). Nowotwory J. Oncol.57, supl. 8.
- Lisowska K,Grzybowska E (2004): Profile ekspresji genów w raku jajnika – poszukiwanie nowych markerów molekularnych i próby klasyfikacji przypadków pod względem rokowania i odpowiedzi na terapię. Onkol.Supl. 1, 21-29
Rak piersi:
- Lisowska KM, Dudaladava V, Jarząb M, Huzarski T, Chmielik E, Stobiecka E, Lubiński J, Jarząb B (2011): BRCA1-related gene signature in breast cancer: the role of ER status and molecular type. Front Biosci. (Elite Ed) 3:125-36; doi: 10.2741/e227
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21196292/
Surowe dane mikromacierzowe (raw data, Gene Expression Omnibus: GSE50567)
- Dudaladava V, Jarząb M, Stobiecka E, Chmielik E, Simek K, Huzarski T, Lubiński J, Pamuła J, Pękala W, Grzybowska E, Lisowska K (2006): Gene Expression Profiling in Hereditary, BRCA1-linked Breast Cancer: Preliminary Report. Hered Cancer Clin Pract. 4(1): 28–38; doi: 10.1186/1897-4287-4-1-28
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3401917/
- Dudaladava V, Jarzab M, Pamula J, Pekala W, Huzarski T, Lubinski J, Grzybowska E, Lisowska K (2005): Gene expression signature of hereditary breast cancer. Breast Cancer Res. 7(Suppl 2): P4.30; doi: 10.1186/bcr1160
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4233581/
Białka stresu komórkowego w raku i cytoprotekcji:
- Fiszer-Kierzkowska A, Vydra N, Wysocka-Wycisk A, Kronekova Z, Jarząb M, Lisowska KM, Krawczyk Z. (2011): Liposome-based DNA carriers may induce cellular stress response and change gene expression pattern in transfected cells. BMC Mol Biol; 12:27. doi: 10.1186/1471-2199-12-27.
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21663599/
Surowe dane mikromacierzowe (raw data, Gene Expression Omnibus: GSE29743)
- Nagy, Z. Balogi, I. Gombos, M. Akerfelt, A. Björkbom, G. Balogh, Z. Török, A. Maslyanko, a. Fiszer-Kierzkowska, K. Lisowska , P. Slotte, L. Sistonen, I. Horváth, L. Vígh (2007): Hyperfluidization-coupled membrane microdomain reorganization is linked to activation of the heat shock response in a murine melanoma cell line. Proc. Natl. Acad. Sci. 104: 7945-50; doi: 10.1073/pnas.0702557104
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17470815/
- Vydra N, Malusecka E, Jarzab M, Lisowska K, Głowala-Kosinska M, Benedyk K, Widłak P, Krawczyk Z, Widłak W. (2006): Spermatocyte-specific expression of constitutively active heat shock factor 1 induces HSP70i-resistant apoptosis in male germ cells. Cell Death Differ. 13(2): 212-22; doi: 10.1038/sj.cdd.4401758
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16151457/
- Rusin M, Zientek H, Krześniak M, Małusecka E, Zborek A, Krzyżowska-Gruca S, Butkiewicz D, Vaitiekunaite R, Lisowska K, Grzybowska E, Krawczyk Z (2004): Intronic polymorphism (1541-1542delGT) of the constitutive heat shock protein 70 gene has functional significance and shows evidence of association with lung cancer risk. Mol. Carcinogen; 39: 155-163; doi: 10.1002/mc.20009
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/14991745/
- Fiszer-Kierzkowska A, Wysocka A, Jarząb M, Lisowska K, Krawczyk Z (2003): Structure of gene flanking regions and functional analysis of sequences upstream of the rat hsp70.1 stress gene. Biochim Biophys Acta.1625(1):77-87; doi: 10.1016/s0167-4781(02)00592-4
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12527428/
- Rafiee M, Kanwar JR, Berg RW, Lehnert K, Lisowska K, Krissansen GW (2001): Induction of systemic antitumor immunity by gene transfer of mammalian heat shock protein 70.1 into tumors in situ. Cancer Gene Ther. 8(12):974-81; doi: 10.1038/sj.cgt.7700395
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11781660/ - Krawczyk Z, Lisowska K (2000): Regulacja ekspresji genów szoku termicznego hsp70i. Biochem. 46: 24-37
Organizmy genetycznie modyfikowane:
- Lisowska K (2014): Socio-economic and safety reasons of rejection of biotechnological and GMO products. In: Biotechnology and Plant Breeding Perspectives, Eds. R.K. Behl and Edward Arseniuk, Agrobios (International) Publisher, Jodhpur, India pp 45-50, ISBN 978-93-81191-01-9
- Lisowska K, Cortez AJ (2014). Kontrowersje wokół długoterminowych badań Gillesa-EricaSeraliniego nad bezpieczeństwem zdrowotnym kukurydzy GMO. Studia Ecologiae et Bioethicae UKSW, 12(2014)3, 33-54
- Lisowska K, M. Gudyka (2013): Wpływ upraw GMO na ekonomikę gospodarstw rolnych, środowisko i stosunki społeczne.W: Poznanie, Kosmos, Cywilizacja (red. E. Dobierzewska-Mozrzymas, A. Jezierski), Studium Generale t. XVII, 105-115
- Lisowska K, Cortez A (2013): Health risk assessment of genetically modified crops in domestic studies – a literature review, J Ecol. Heath, 1/2013.
- Lisowska K (2011): Genetically modified crops and food: pros and cons. Chemik 65, 11: 1193-1203.
- Lisowska K, Chorąży M (2011): Dlaczego mówimy nie dla GMO w polskim rolnictwie NAUKA 4/2011: 173-178.
- Lisowska K, Chorąży M (2011): Zboża genetycznie modyfikowane (GM) w rolnictwie – aspekty zdrowotne, środowiskowe i społeczne Biuletyn Komitetu Ochrony Przyrody PAN2/2011
- Lisowska K, Chorąży M (2010): Genetycznie zmodyfikowane uprawy i żywność – przegląd zagrożeń. Nauka 4 /2010: 127-136.
- Lisowska K (2010): Genetycznie modyfikowane uprawy a zrównoważone rolnictwo i nasze zdrowie. Journal of Ecology and Health; 6: 303-309.
Inne (Other)
- Lisowska K, Krawczyk Z. Profesor Mieczysław Chorąży. Wspomnienie. NAUKA 2/2021 195–204. DOI: 10.24425/nauka.2021.136324
https://journals.pan.pl/nauka/136324 - Zarczynska I, Gorska-Arcisz M, Cortez AJ, Kujawa KA, Wilk AM, Skladanowski AC, Stanczak A, Skupinska M, Wieczorek M, Lisowska KM, Sadej R, Kitowska K (2021): p38 Mediates Resistance to FGFR Inhibition in Non-Small Cell Lung Cancer. Cells 10(12): 3363; doi: /10.3390/cells10123363
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34943871/
- Olbryt M, Habryka A, Student S, Jarząb M, Tyszkiewicz T, Lisowska KM.(2014): Global gene expression profiling in three tumor cell lines subjected to experimental cycling and chronic hypoxia. PLoS One. 14;9:e105104; doi: 10.1371/journal.pone.0105104.
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25122487/
Surowe dane mikromacierzowe (raw data, Gene Expression Omnibus: GSE53012)
- Rusin A, Zawisza-Puchałka J, Kujawa K, Gogler-Pigłowska A, Wietrzyk J, Świtalska M, Głowala-Kosińska M, Gruca A, Szeja W, Krawczyk Z, Grynkiewicz G (2011): Synthetic conjugates of genistein affecting proliferation and mitosis of cancer cells. Bioorgan. Med. Chem., 19: 295–305; doi: 10.1016/j.bmc.2010.11.024
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21129977/
- Lisowska K, Jarząb M (2004): Zastosowania mikromacierzy w biologii molekularnej i naukach medycznych. W: Na Pograniczu Chemii i Biologii, red. H. Koroniak, J. Barciszewski, Uniwersytet im. Adam a Mickiewicza w Poznaniu, Wyd. Nauk. Poznań, t. X, 401-427.
- Wiench M, Wygoda Z, Gubała E, Włoch J, Lisowska K, Krassowski J, Ścieglińska D, Fiszer-Kierzkowska A, Lange D, Kula D, Zeman M, Roskosz J, Kukulska A, Krawczyk Z, Jarząb B (2001): Estimation of risk of inherited medullary thyroid carcinoma in apparent sporadic patients. J Clin Oncol. 19(5): 1374-80; doi: 10.1200/JCO.2001.19.5.1374.
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11230481/
- Mucha M, Lisowska K, Goc A, Filipski J (2000): Nuclease-hypersensitive chromatin formed by a CpG island in human DNA cloned as an artificial chromosome in yeast. J. Biol. Chem; 275: 1275-1278.
Projekty Badawcze
Okres | Numer projektu | Kierownik / koordynator | Tytuł |
2019 – 2020 | Miniatura 3 | Dr Katarzyna Kujawa | Wstępna ocena związku wybranych białek (DSPG3, LOX, FN1, POSTN, MFAP5, CLASP1) z cechami kliniczno-patologicznymi raka jajnika |
2016 – 2020 | Grant Nr STRATEGMED II/266766/17/NCBR/2015 | dr. hab. K. Lisowska | Opracowanie nowoczesnych biomarkerów oraz rozwój innowacyjnego inhibitora kinaz FGFR stosowanego w terapii nowotworów [CELONKO] |
2012 – 2015 | Grant 2012/04/M/NZ2/00133 | dr. hab. K. Lisowska | Projekt Harmonia: „Biologiczne oddziaływania komórek raka jajnika z komórkami macierzystymi trzewnej tkanki tłuszczowej (omental derived adipose stem cells, O-ASC)” |
2006 – 2010 | Grant Nr PBZ-MNiI2/1/2005 | prof. Włodzimierz Ostrowski – COI Warszawa | Projekt zamawiany: „Zastosowanie współczesnej genomiki funkcjonalnej i bioinformatyki do charakteryzacji i tworzenia modeli procesów biologicznych o istotnym znaczeniu w medycynie i rolnictwie” Projekt badawczy: „Znaczenie podstawowych molekularnych cech nowotworu oraz jego mikro-środowiska jako determinant profilu ekspresji genów” (dr Katarzyna Lisowska – kierownik zadania, mgr Magdalena Olbryt – główny wykonawca) |
2008 – 2009 | Grant Nr N N401 231234 | prof. Zdzisław Krawczyk – COI Gliwice | „Poszukiwanie molekularnej sygnatury hipoksji w czerniaku”, (grant promotorski – mgr Magdalena Olbryt) |
2003 – 2006 | PBZ-KBN-091/P05/2003 | prof. Ewa Grzybowska – COI Gliwice | Projekt zamawiany: „Badania nad molekularną patogenezą nowotworów oraz wykorzystanie metod biologii molekularnej, genomiki i proteomiki dla wczesnego wykrywania, optymalizacji leczenia i rozwoju nowych metod terapii nowotworów złośliwych”Projekt badawczy:„Porównanie profilu ekspresji genów w rakach jajnika uwarunkowanych obecnością dziedzicznych mutacji i polimorfizmów oraz w sporadycznych rakach jajnika” (dr Katarzyna Lisowska – kierownik zadania, mgr Magdalena Olbryt – główny wykonawca) |
2001 – 2004 | PBZ/KBN/040/P04/2001 | prof. Barbara Jarząb, COI – Gliwice | Projekt zamawiany: „Zastosowanie metod nowoczesnej genomiki funkcjonalnej do rozwiązania istotnych problemów z zakresu biotechnologii i medycyny”. Projekty badawcze: 1. „Profil ekspresji genów w komórkach nowotworowych czerniaka B16(F10) in vitro w warunkach hipoksji”; mgr Magdalena Olbryt, główny wykonawca 2. „Badanie wzoru ekspresji genów metodą mikromacierzy DNA w genetycznie uwarunkowanych nowotworach piersi w porównaniu do nowotworów sporadycznych” prof. Ewa Grzybowska – kierownik zadania; dr Katarzyna Lisowska – główny wykonawca |